Após a vitória conquistada diante do Fluminense de Feira de Santana, o Náutico avançou para terceira fase da Copa do Brasil e encara o vencedor do duelo entre Cuiabá e Aparecidense. o feito alcançado nessa quarta, já iguala a trajetória alvirrubra de 2015, quando a equipe derrotou Brasília e Jacuipense e foi eliminada pelo Flamengo.
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Para equiparar as melhores campanhas do clube, no entanto, o time comandado por Roberto Fernandes precisa progredir ainda mais.
Das 19 participações do Timbu no torneio, em seis chegou até as oitavas de final. Em 1989 e 2003, caiu diante do Atlético-MG, em 1993 perdeu para o Cruzeiro, que se sagraria campeão. Já em 2006, foi derrotado pelo Ipatinga, enquanto em 2009 o algoz foi o Internacional. Por último, o Vasco tratou de despachar os alvirrubros na mesma fase, em 2011.
Já em 2007, o Náutico se destacou ao alcançar as quartas de final. Naquela participação, o time saiu em confronto contra o Figueirense, tendo eliminado o Corinthians nas oitavas.
Mas o ano de melhor desempenho foi 1990, na segunda edição da Copa do Brasil. Na época, o Náutico passou pelo Treze-PB na primeira eliminatória, atropelou o Ceará nas oitavas e o Remo nas quartas, sendo parado apenas pelo Flamengo na semifinal. Os cariocas ainda viriam a levantar o título naquele ano.
Por outro lado, nas últimas vezes que esteve na competição deixou a desejar. Além da já citada eliminação em 2015, os alvirrubros saíram logo na segunda fase em 2014, após serem superados pelo América de Natal. No ano passado, um tropeço ainda maior. Diante do Guarani de Juazeiro, o Timbu sucumbiu na primeira fase após derrota por 1x0, no estádio Romeirão.
Confira o desempenho alvirrubro ano a ano:
1989 - Oitavas de Final
1990 - Semifinal
1992 - 1ª Fase
1993 - Oitavas de Final
1995 - 1ª Fase
1999 - Fase Preliminar
2000 - 2ª Fase
2001 - 1ª Fase
2002 - 2ª Fase
2003 - Oitavas de Final
2005 - 2ª Fase
2006 - Oitavas de Final
2007 - Quartas de Final
2009 - Oitavas de Final
2010 - 2ª Fase
2011 - Oitavas de Final
2014 - 2ª Fase
2015 - 3ª Fase
2017 - 1ª Fase
